成药性分析

简介

成药性分析软件(Druggability Analysis Software, DAS)是大湾生物(GBB)开发的针对生物蛋白质分子模拟及计算机辅助设计药物评估优化的综合性软件系统。DAS系统是集蛋白质结构预测、可视化、分析及序列优化为一体的综合软件。客户通过对蛋白质结构预测、亲/疏水基团分析、正/负电荷聚集、免疫原性(人源化)、分子对接及亲和力分析,全面评估候选蛋白质分子成为可开发、安全、有效药物的潜力。在候选蛋白质分子进入CMC阶段前,DAS系统能够帮助客户快速地对候选分子进行筛选及改造,减少试错成本,加速新药研发进程。


主要功能

· 蛋白质分子结构预测
DAS系统拥有成熟的蛋白质分子结构预测算法,基于GBB超强的算力平台,根据蛋白质氨基酸序列直接预测其结构,并且提供蛋白质结构的可视化界面。

· 可开发潜力分析
基于蛋白质分子的氨基酸序列,以及预测的分子结构,系统全面评估亲/疏水基团分布、正/负电荷聚集程度、免疫原性(人源化),通过可视化界面,我们可直观展示蛋白质分子结构可能影响可开发性的氨基酸残基。

· 亲和力分析
DAS系统同时可以对抗原抗体对接结构进行准确预测,并且评价其亲和力,帮助生物公司高通量筛选候选抗体分子。

· 药物的虚拟改造
基于以上分子结构预测、可开发及成药性分析的能力,DAS系统提供基于分析结果的蛋白质分子改造服务,提供给客户可开发、高成药性的蛋白质分子序列,降低蛋白质药物开发成本。

其它:GBB自研信号肽设计算法和密码子优化算法,可以定制化设计蛋白质分子信号肽序列,优化蛋白质分子密码子序列,帮助生物公司提高蛋白质表达量。


优势

· 准确率高,速度快

目前各生物公司使用的分子分析软件多数基于传统的结合自由能物理模拟方法,而GBB成药性分析软件基于成熟的蛋白分子结构预测算法,以及GBB超强的算力平台,可以准确且快速的完成基于结构的蛋白分子成药性分析。


· 易上手,可批量操作
类似DOE的成药性分析软件,需要操作人员具备一定的技术基础,并且每一个蛋白质分子只能单独分析,而DAS系统可以同时批量分析100个以上蛋白质分子,并且上传输入文件即可获得结果,不需额外操作。


· 服务方式灵活
GBB成药性分析软件提供国产化替代,相较国外的商业软件收取年费的服务方式,国产软件的合作方式更加灵活,提供的服务能够得到更及时的反馈。

· 专注蛋白分子开发领域
相较于其它分子分析软件,GBB成药性分析软件专注于生物大分子领域,及时更新AI算法,帮助生物公司领先竞品药物研发进度。


服务流程



案例


· 案例1


· 案例2


· 注释

*疏水性集中程度评估得分大于8,可能由于表面疏水基团过于集中而引起聚集。
*疏水分布程度评估得分大于12,可能由于表面疏水基团过多而引起非特异性结合。
*正/负电荷集中程度评估得分比较高,会增加蛋白质的黏度,导致在高浓度溶液下产生沉淀。
*电荷不对称分数小于-4,会导致蛋白质表面带相反电荷,蛋白质之间产生静电力导致自相吸引而沉淀。
*电荷不对称分数高于12则正负电荷过多,导致非特异性结合倾向。
*人源化评估得分低于50,引起免疫反应的概率会提高。
*稳定性评估得分低于56,蛋白质容易被降解从而影响蛋白质功能。
*蛋白质在等电点时不带电荷,因为没有电荷相互排斥的影响,最不稳定,溶解度降低,容易沉淀析出。



试用


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